Vào năm UC 79, con người sống trên các colony không gian gọi là side. Side 3, công quốc Zeon, đã phát động chiến tranh với Liên Bang Trái Đất. Sau những trận đánh ko cân sức , 8 tháng dài vào thế kẹt.
Cookingdom là lĩnh vực bí ẩn chịu trách nhiệm về tất cả các món ăn trong thế giới của chúng ta. Câu chuyện bắt đầu khi Recipe-Bon, nơi ghi công thức cho mọi món ăn, bị đánh cắp khỏi Cookingdom.
Thảm kịch "Bloody Valentine" đã leo thang thành một cuộc chiến giữa Liên Minh Trái Đất và ZAFT. Cuộc chiến ngày càng trở nên nghiêm trọng. Khiến rất nhiều sinh mạng phải hy sinh, họ đã đạt được thỏa thuận ngừng bắn sau cuộc chiến thứ hai ở Yakin Do. Tuy nhiên, thỏa thuận ngừng bắn đã không hoàn toàn khắc phục được xung đột giữa Naturals và Coordinators.Trong suốt cuộc chiến, Shinn Asuka đã tham gia vào Liên Minh Trái Đất để thâm nhập vào Orb. Trong lúc thoát khỏi đám cháy, cậu ta đã mất cha mẹ
Series mới này sẽ mang một cốt truyện hoàn toàn mới, không có trong manga gốc của Daisuke Ashihara. Sẽ có thêm các nhân vật và tình tiết mới. Dàn cast bao gồm Tomo Muranaka (Yūma Kuga), Yuuki Kaji (Osamu Mikumo), Nao Tamura (Chika Amatori), Nobuhiko Okamoto (Jun Arashiyama), và Masakazu Morita (Shūji Miwa) đã xuất hiện trong sự kiện nhưng vẫn chưa biết gì về chi tiết của series mới.
Nanase Takeshi, một tên nam sinh bình thường, có chút hơi hướng tự kỉ, vô tình gặp được một nữ sinh, đến từ một trường nào đó mà cậu không hề biết. Cuộc gặp gỡ đó đã thay đổi toàn bộ cuộc đời của Nanase